Discussion :

[yoyo42300]

Bonjour,

Je viens vers vous car je souhaite acheter un nouveau PC (fixe) afin de faire tourner mes programmes Matlab.
J'ai regardé un peu sur le net les possibiliés de processeurs ... je me suis également apperçu qu'il était peut être possible de faire tourner plusieurs calculs en parrallèle, mais tout ceci reste un peu obscure pour moi ...
Voici le type de calculs que je réalise actuellment sur mon PC portable (Window 7, intel core i3 cpu 2;13 GHz, 2 coeurs, RAM, 4 Go)

Le programme simple comprend en moyenne 3 solvers d'équations différentielles de type ODE113 (2.3 secondes avec un tic toc pour faire tourner le prog en entier sans aucuns affichages). A partir de là je lance une optimisation avec 6 à 10 paramètres à obtimiser. Cette optimisation consiste à trouver un minimum global. J'utilise une fonction s'apparantant à un fminsearch qui ne donne que des minimum locaux, ainsi je dois lancer l'optimisation en partant de différents points de départ pour trouver mon minimum global.

Pour avoir une idée, actuellement je lance l'optimisation avec 12 points de départ (le nbr d'itération n'est as fixé), j'obtiens le résultat 2h15 plus tard.
Temps raisonnable sauf quand le nombre d'optimisation est multiplié.

Je souhaitais donc savoir quel matériel vous me conseillerez d'acheter et si il est possible de lancer des calculs en parallèles (de préférence avec un seul PC fixe).

J'éspère avoir été assez précis dans mes explications

Cordialement

Yoann

[Jerome Briot]

Pour ce qui est des possibilité de parallélisation, je te renvoie vers cette discussion : Multicoeurs et vitesse de calcul (surtout le dernier message)

Maintenant, il n'est jamais facile de répondre à ce type de question...

Quel est ton budget maxi ?
Quelle version de MATLAB utilises-tu ?
Ta licence est-elle à jour (mise à jour possible de MATLAB) ?
As-tu les moyens d'acheter une licence pour la Parallel Computing Toolbox ?

[yoyo42300]

Merci pour le lien je vais regarder attentivement.

J'ai oublié de préciser ma version de matlab en effet : R2009b 32 bits

Au niveau budget c'est un peu compliqué car c'est le labo dans lequel je traial qui investira, donc il faut que je leur propose ...

Si on met les calculs en parrallèles de côté, peux tu me dire quelle machine tu achèterais. Penses-tu qu'il y aura des améliorations par rapport à mon pc portable (cf. composition au dessus).

Car je suppose que la puissance du pc compte jusqu'à un certain point mais qu'après c'est le programme qui est long ou non.

merci

[Jerome Briot]

Alors oublions la Parallel Computing Toolbox...

Quel est la référence exacte du processeur i3 sur lequel tu travailles ?
Est-ce celui-ci ?

Avec quel marque ton labo a-t-il le marché ?

N'y-a-t-il pas dans ton labo des machines plus puissantes avec différents processeurs sur lesquels tu pourrais faire quelques benchmark ?
Il serait intéressant de tester sur un i7 ou un Xeon Quad core

Je ne suis pas un expert des microprocesseurs, mais d'après ce que je comprends, MATLAB ne gère pas (encore?) bien l'hyperthreading
Voir le message 4 de cette discussion maxNumCompThreads default value limits performance R2011a qui date de juin 2011 et qui est écrit par un membre de MathWorks

La différence se ferait donc en priorité sur le nombre de cœurs (2 pour i3/i5, 4 pour i7 et 2/4/6 pour Xeon). Et bien entendu sur la fréquence du CPU.

Je viens de faire un test simple sur mon i5 (2 coeurs / 4 threads ) :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
n = 5000;
A = rand(n);
B = rand(n);
clc
 
for n = 1:4
 
    clear C
 
    maxNumCompThreads(n);
 
    tic
    C = A*B;
    toc
 
end

Résultats :

Elapsed time is 22.763492 seconds.
Elapsed time is 12.507502 seconds.
Elapsed time is 12.434471 seconds.
Elapsed time is 12.389451 seconds.

D'ailleurs, tu peux voir l'influence du nombre de cœurs dans ton cas en utilisant maxNumCompThreads(1); avant de lancer ton calcul. Comme ça tu verras le gain avec 2 cœurs.

Mais revenons quand même à la Parallel Computing Toolbox...
La licence Educative coute entre 200 et 350 Euros...
Il ne serait pas idiot de réfléchir à une alternative en économisant quelques euros sur la machine, non ?
Il faudrait bien entendu tester cette Toolbox pour savoir si ton code peut en tirer profit.

Pense à contacter MathWorks pour des infos plus précises et tu peux également télécharger une version d'essai de cette Toolbox (si ta licence est à jour bien sûr).

Voila, j'espère avoir apporté un peu d'eau à ton moulin sans trop avoir dis de bêtises

[yoyo42300]

merci beaucoup pour toutes ces infos.

je vais déjà faire un petit test pour le nombre de coeurs.
et je vais me renseigner de plus près pour la toolbox, ça peux en effet valloir le coup.

Merci encore