Discussion :

[alaninho]

Bonjour,

J'aimerai savoir comment on peut remplacer des chemins absolus par des chemin relatifs.

Par exemple ;

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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def showDialog_msa1(self):
        self.filename_msa1 = QFileDialog.getOpenFileName(self, 'Open file', '/home/lahure/Documents')
        fname = open(self.filename_msa1)
        self.data_file_msa1 = fname.read()
        self.namefile_msa1.setText(self.filename_msa1)

ou ici ;

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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def treatment(self):
        self.parserfile()
        tabID=[]
        tabseq=[]
        tablength=[]
        sequence=""
        i=0
        fich=open("/home/lahure/Documents/msadiff/files/"+self.file_read,"r")
        for line in fich:
            line=line.replace("\n","")
            line=line.replace(".","-")
            if re.match("^>",line):
                id_len=line.split("/")
                tabID.append(id_len[0])
                tablength.append(id_len[1])
                tabseq.append(sequence)
                sequence=""
            else:
                sequence=sequence+line
                sequence=sequence.upper()
        tabseq.append(sequence)
        tabseq.remove("")
        length=len(tabseq)
        self.set_seq_object(tabID, tablength, tabseq, length)

J'aimerai ne plus avoir de chemin absolu, mais je sais pas du tout comment faire.

Alaninho

[Golgotha]

Bonjour,

Tu peux peut être utiliser la commande :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

os.getcwd()

qui te permet d'avoir le chemin du fichier .py que tu exécute, à partir de ce chemin, à toi de compléter l'adresse.

Ou, de mettre "/home/lahure/Documents" en variable de configuration, comme ça si ça change tu ne le change qu'une seule fois dans ton programme.

[alaninho]

Je peux pas utiliser /home/lahure/documents car ensuite le programme sera sur un serveur et donc l'accès à mon compte sera privé.
Tu peux me donner un exemple avec la commande os.getcwd() stp.

Merci

[kango]

bonjour,

avec os.path.relpath

[rambc]

Bonjour.

os.getcwd() va renvoyer le dossier d'où est lancé le script, et non où est le script.

Personnellement, j'utilise : os.path.dirname( __file__ ).

[alaninho]

Merci, pourrai-je avoir un exemple avec os.getcwd(), car je comprend par en quoi elle remplace le chemin absolu.

[mont29]

alaniho, l’idée est bien de mettre “en dur” dans ton code un chemin relatif vers ton/tes fichiers ?

Dans ce cas, il faut que tu récupères la racine courante de ce chemin relatif.

os.getcwd() va te retourner le chemin absolu vers le dossier d’où a été lancé ton script (le dossier courant dans la console dans laquelle tu l’as lancé, par ex.)

os.path.dirname(__file__) va te retourner le chemin absolu vers le dossiercontenant ton script (file étant une variable spéciale qui contient toujours le chemin absolu vers le fichier du script).

À toi de voir quelle option (quelle racine) te conviendrait le mieux.

Ensuite, une fois que tu as ta racine, tu la joint à ton chemin relatif pour obtenir le chemin définitif.

Par exemple, en supposant que tes fichiers soient dans un dossier data, frère du dossier contenant ton script, tu fais :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import os
root = os.path.dirname(__file__)
rel_path = os.path.join("..", "data")
 
abs_path = os.path.join(root, rel_path)
 
# Tu peux maintenant utiliser abs_path…

PS : Utilise toujours os.path.join pour assembler les éléments de test chemins, comme ça python se charge de gérer les différents séparateurs selon l’OS courant (/ sous Unix, \ sous Windows, etc.).

[plxpy]

Bonjour,

à mon avis, le problème que tu poses (comment remplacer des chemins absolus par des chemins relatifs) est ... un faux problème.

Comme tu le dis toi-même :

le programme sera sur un serveur et donc l'accès à mon compte sera privé

Donc, voir figurer, en dur, dans ton code, des chemins faisant explicitement référence à la sous-arborescence liée à ton compte utilisateur est très vilain, que tu utilises des chemins absolus ou relatifs. Le passage chemins absolus -> chemins relatifs n'y changera strictement rien.

Tu dois plutôt te poser la question de l'emplacement des fichiers que l'utilisateur aura à manipuler.

Si ce sont des fichiers communs à plusieurs utilisateurs, il faudra les mettre à un endroit constant (pas fonction de l'utilisateur) dans l'arborescence standard (Unix/Linux vu les "/" et "/home") et, tant qu'à faire, pas trop idiot.

S'ils sont propres à chaque utilisateur, il faut les mettre dans la sous-arborescence de l'utilisateur, soit à un endroit fixe soit à un endroit que peut fixer l'utilisateur (via une variable d'environnement par exemple, valeur que tu récupères via un os.getenv).

Une fois que tu auras organisé tout ça sur le papier, la problèmatique des chemins absolus ou relatifs tombera d'elle même.

scrogneugneu : os.getcwd ne donne pas le répertoire d'où on a lancé le script !!! Ca fournit le path absolu du répertoire courant ! Dans certains cas et sous certaines conditions seulement, ces deux chemins peuvent être les mêmes

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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mac0908mt070:~ pascal$ more ou.py
# -*- coding:utf-8 -*-
import os
os.chdir('/')
print "aurais-je lancé mon script depuis %s ???" % os.getcwd()
mac0908mt070:~ pascal$ pwd
/Users/pascal
mac0908mt070:~ pascal$ python ou.py
aurais-je lancé mon script depuis / ???
mac0908mt070:~ pascal$

[alaninho]

c'est exactement ça plxpy, l'utilisateur utilsera ces propres fichiers venant soit de son disque dur soit d'un serveur, mais je vois pas comment cela est un faux problème. Peux tu m'expliquer d'avantage stp?

merci

Alaninho

[plxpy]

C'est un faux problème parce que tu mets in extenso "/home/lahure/ ..." dans ton code.

Tu ne peux pas espérer rendre ce code utilisable par tout le monde : tu dis toi même que ton espace sera privé. Donc, pourquoi ce "/home/lahure" dans le code ??? Ca aurait un sens si, systématiquement, les fichiers à utiliser par tous les utilisateurs se trouvaient sous /home/lahure (se poserait ensuite le problème des droits d'accès ...)

Le fait que les chemins soient absolus ou relatifs n'a pas d'importance : si ils désignent quelque chose sous /home/lahure, c'est foutu.

Dans ton premier exemple de code, ne mets pas dans les arguments un path lié à ton compte utilisateur :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

self.filename_msa1 = QFileDialog.getOpenFileName(self, 'Open file', '/home/lahure/Documents')

mais quelque chose de plus neutre (par exemple le répertoire de login de l'utilisateur)

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

self.filename_msa1 = QFileDialog.getOpenFileName(self, 'Open file', os.getenv("HOME"))

Je ne suis pas expert en IHM mais, généralement, cet argument correspond au répertoire dans lequel l'utilisateur se retrouve dans la fenêtre de sélection de fichiers. Libre ensuite à lui d'aller ailleurs.

Et pour le deuxième bout, stocke "ce qui va bien" dans l'attribut file_read. On a l'impression que tu y mets un nom simple d'un fichier forcément placé sous /home/lahure/Documents/msadiff/files : d'après ce que tu dis, ça ne semble pas être le cas.

[mont29]

scrogneugneu : os.getcwd ne donne pas le répertoire d'où on a lancé le script !!! Ca fournit le path absolu du répertoire courant ! Dans certains cas et sous certaines conditions seulement, ces deux chemins peuvent être les mêmes

Oui, en effet… J’ai écrit trop vite…

[alaninho]

Merci plxpy, c'est vrai c'est un faux problème.
Tout exemple m'a bien aidé.

Alaninho