Discussion :

[nathalie02]

Bonjour à toutes et à tous.

Je voudrais, à partir d'un fichier .cvs, générer une heapmap.
Actuellement, j'ai réalisé toutes mes heatmaps sans problème en niveau de gris.
Hors, lorsque j'essaye de les réaliser en couleur via la fonction :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

heatM <- heatmap(mat, Rowv=NA, Colv=NA, scale="none", margins=c(5,10))

Je m'aperçois que les couleurs sont "inversées".

Pour mieux vous représenter ce que je veux dire, je vous joins une de mes heatmaps.

En fait, ce que je voudrais avoir est, pour le bas de la heatmap, une première colonne "foncée" (-> rouge), la deuxième claire (-> jaune), la troisième foncée (-> rouge), etc.
Naturellement quand je parle de "rouge" et "jaune" je veux dire "avec toutes les nuances de couleurs entres les deux (jaune pâle, jaune, jaune-orangé, etc.). Je voudrais faire cela car sinon, ma heatmap ne me donne pas un résultat concordant avec mes données.

En niveau de gris, j'ai effectivement "noir, "blanc "noir", etc. et pour le coup, c'est cohérent avec mes données.

Pourquoi n'ai-je pas le même rendu en couleur ?

Merci d'avance pour vos conseils/réponses !

Nath