Discussion :

[mathieu_r]

Bonjour,

Je débute sous imageJ. Ma question est totalement débutante, je pense.

J'ai une couverture aérienne d'un territoire en niveaux de gris.

J'ai pu discriminer avec un outil de segmentation les zones anthropisées des zones naturelles. Le résultat est une image binaire.

Je souhaite effectuer une deuxième analyse sur mon image en niveaux de gris sur la base du masque binaire obtenu. En l'occurrence, je ne souhaite travailler qu'au sein des zones anthropisées qui correspondent aux zones blanches de mon masque

Je me demande donc comment utiliser le masque obtenu pour l'analyse de mon image en niveaux de gris.

En vous remerciant par avance,

mathieu

[onylink]

Salut,

Je fais un travail un peu identique en ce moment, le matériel biologique étant juste différent.

Après avoir obtenu mon masque, j'extrais chaque régions d’intérêt ("blanche") et ensuite je fais mon analyse sur chaque régions.

Je ne sais pas si cela peut t'aider ou pas comme réponse, mais je n'ai pas trouvé de plugin capable de le faire directement.. Du coup, il faut mettre les mains dans le cambouis

[ToTo13]

+1
- soit tu décomposes ton image en deux sous images en mettant à 0 (noir) les parties qui ne t'intéressent pas.
- soit tu reprogrammes tous les algorithmes dont tu as besoin pour qu'ils ne prennent en compte lors de leurs traitements que la partie souhaitée.

[g17735]

salut,
une fois que tu as ton image binaire, tu définis automatiquement une sélection (edit/selection/create selection)
ensuite tu ouvres le gestionnaire de sélections (analyze/tools/roi manager)
et tu ajoutes ta nouvelle sélection dans le manager en cliquant sur le bouton "add"

il te suffit ensuite d'ouvrir ton image originale et d'activer ta sélection dans le roi manager et cliquant sur la ligne correpondante.
tu peux ainsi gérer plusieurs sélections sur une même image !