Discussion :

[EaudeRoche]

Bonjour,

je cherche à exporter une matrice de matlab sous R

Pour cela j'utilise R-link:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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[status,msg] = openR;
if status ~= 1
    disp(['Problem connecting to R: ' msg]);
end
dat1=[1 2 3]
putRdata('dat1',dat1);
evalR('save(dat1, file="./dat1.RData")');
closeR

mais la connexion avec R ne se fait pas via openR:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

Problem connecting to R: Error: Object returned error code: 0x80040013

J'ai essayer de réinstaller R dans un autre emplacement, une version plus récente etc.
mais rien ne semble fonctionner j'ai toujours cette erreur...

J'ai essayé de suivre les conseils de http://mailman.csd.univie.ac.at/pipe...ay/002123.html mais j'ai dû mal m'y prendre puisque ça ne fonctionne toujours pas!

Etant donné le peu de chose que j'ai trouvé sur les forums francophones ce problème est assez rare, mais svp aidez moi

Merci d'avance pour votre aide

[Jean Dumoncel]

Bonjour,

je ne vais pas répondre directement à ton problème, mais dans quel but cherches-tu à faire ceci? Ne serait-il pas plus facile d'enregistrer ta matrice dans un fichier texte (en csv par exemple) et de l'ouvrir dans R?

[EaudeRoche]

D'abord merci pour votre aide

J'avais plus ou moins tenté ça avant avec:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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S = load('stat1.mat');
NAMES = fieldnames(S);
EXT = '.dat';
for i = 1:length(NAMES)
    cNAME = NAMES{i};
    DATA = getField(S,cNAME);
    FILEname = sprintf('%s%s',cNAME,EXT);
    save(FILEname,'DATA','-ascii');
end

mais j'avais ce warning

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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Warning: Could not find an exact (case-sensitive) match for 'getField'.
C:\Program Files\MATLAB\R2011a\toolbox\matlab\datatypes\getfield.m is a case-insensitive
match and will be used instead.
You can improve the performance of your code by using exact
name matches and we therefore recommend that you update your
usage accordingly. Alternatively, you can disable this warning using
warning('off','MATLAB:dispatcher:InexactCaseMatch').
This warning will become an error in future releases.

ça m'enregistrait bien un fichier mais quand j'ai essayé de l'ouvrir sous R ça n'a pas fonctionné... (et en matlab ça ne semble pas fonctionner non plus, il me dit que le fichier est vide)

Mais peut être m'y suis je mal pris? J'ai aussi essayer en .txt mais je n'arrivais pas à le faire lire correctement sous R... Si vous avez un code, je suis preneur... pour qu'au moins je puisse avancer via R.

En fait finalement mon soucis c'est peut être pas seulement de l'enregistrer mais de l'ouvrir sous R aussi...

Et puis j'ai l'intention d'utiliser un code Matlab pour lancer des fonctions R via evalR('blabla'); donc ce serait tout de même cool que ça puisse fonctionner tout de même. C'est juste que là je veux faire ça pour me simplifier la vie en codant directement sous R sans passer par Matlab... Mon titre est peut être mal choisi, en fait c'est openR que je n'arrive pas à faire marcher et qu'il faudrait vraiment que je fasse fonctionner

[EaudeRoche]

oui ça fonctionne ça marche avec

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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csvwrite(mon_emplacement, data)%sous matlab
%sous R
data<-read.table("C:/fichier_import.csv",sep=";") 
%ou bien
data<-read.csv("C:/fichier_import.csv",sep=";")

Le problème c'est que ça ne me prend mes variables que par ligne de ma matrice, j'aimerai dissocier mes colonnes ET mes lignes dans ma variable R...

[EDIT: data<-read.csv("C:/fichier_import.csv") marche très bien... désolé! ]

Sinon ma question pour openR est toujours d'actualité