Discussion :

[BIG123]

fichier1

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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1bcfA 1b9bA 728.0
1nat_ 1b9bA 703.0
1nat_ 1bcfA 431.0
1rn1C 1b9bA 858.0
1rn1C 1bcfA 498.0
1rn1C 1nat_ 405.0
2plt_ 1b9bA 901.0
2plt_ 1bcfA 561.0
2plt_ 1nat_ 432.0
2plt_ 1rn1C 379.0

fichier2

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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1nat_ 166.0
2plt_ 101.0
1b9bA 211.0
1bcfA 251.0
1rn1C 19.0

script

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#!/bin/ksh
fichierDist=/udd/me/test/fichierDist.txt;
fichierRayo=/udd/me/test/fichierRay.txt;
eval $(sed -e 's/  */=/' $fichierRayo)
while read Ri Rj Dk ; do
    d=$(($Ri + $Rj - Dk))
    if [[ $d -gt 0 ]]
    then echo "$Ri et $Rj se chevauchent avec une distance de: $d" 
    elif [[ $d -lt 0 ]]
    then echo "$Ri  et $Rj ne se chevauchent et ils sont distants de: $((-d))" 
    else echo "$Ri  et $Rj sont limites " 
    fi
done < $fichierDist

et même si j'ai changé mes deux fichiers en mettant des valeurs exactes (pas des .0)
il y a toujours l'erreur

[jack-ft]

@jack-ft eval == evil!

C'est pas faux...

Un petit malin pourrait effacer tout le disque...

Surtout avec l'option -e! Danger!

Tu parles de 'set -o errexit' ? Je ne vois pas le rapport

Sinon, avec un bon interprète (ksh, bash ou perl), on peut aussi utiliser des tableaux associatifs... pour associer une valeur à... un identifiant, non?
N'est-ce pas d'ailleurs ce que fait ton instruction a[$1]=$2 ?

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#!/bin/ksh
 
while read Ri ri ; do
    diam[$Ri]=$ri
done < fichier1
 
while read Ri Rj Dk ; do
    d=$((${diam[$Ri]} + ${diam[$Rj]} - Dk))
    if [[ $d -gt 0 ]]
    then print "$Ri et $Rj ne se chevauchent pas et ils sont distants de: $d"
    elif [[ $d -lt 0 ]]
    then print "$Ri et $Rj se chevauchent avec une distance de: $((-d))"
    else print "$Ri et $Rj sont limite"
    fi
done < fichier2

[jack-ft]

fichier1

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1bcfA 1b9bA 728.0

Oops! Mon code fait l'assomption que la 1ère colonne contient ce qui peut être vu par le shell comme un identifiant, c'est-à-dire une lettre suivie de chiffres ou lettres ou _
Comme des éléments commencent par un chiffre, ça ne peut pas marcher!
Essaie avec le code sans eval que je viens de poster... mais qui ne marche que pour des entiers...

PS: je crois que le code de ripat fonctionne avec des flottants...

[BIG123]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#!/bin/ksh
 
while read Ri ri ; do
    diam[$Ri]=$ri
done < fichier1
 
while read Ri Rj Dk ; do
    d=$((${diam[$Ri]} + ${diam[$Rj]} - Dk))
    if [[ $d -gt 0 ]]
    then print "$Ri et $Rj ne se chevauchent pas et ils sont distants de: $d"
    elif [[ $d -lt 0 ]]
    then print "$Ri et $Rj se chevauchent avec une distance de: $((-d))"
    else print "$Ri et $Rj sont limite"
    fi
done < fichier2

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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test/R-R.sh: line 5: 1nat_: value too great for base (error token is "1nat_")
test/R-R.sh: line 8: 1bcfA: value too great for base (error token is "1bcfA")

[BIG123]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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NR==FNR {
	a[$1]=$2;next
}
{
	if (a[$1]+a[$2]<=$3){
		if(a[$1]+a[$2]==$3){
			s="limite"
		} else {
			s="pas de ch."
		}
	} else {
		s ="chevauchement"
	}
	print $0,s
}

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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fichierDist=/udd/me/test/fichierDist.txt;
fichierRayo=/udd/me/test/fichierRay.txt;
NR==FNR {
	a[$1]=$2
	next
} 
{
	d=a[$1]+a[$2]-$3
	s=d<=0 \
		? d==0 \
			? "sont limite" \
			: "ne se chevauchent pas et sont distants de: " d*-1 \
		: "se chevauchent avec une distance de: " d
 
	echo "%s et %s %s\n", $1, $2, s
}
awk -f a.awk $fichierDist $fichierRayo

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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awk: fatal: can't open source file `a.awk' for reading (No such file or directory)
test/R-R.sh: line 5: {: command not found
test/R-R.sh: line 7: next: command not found
test/R-R.sh: line 8: syntax error near unexpected token `}'
test/R-R.sh: line 8: `} '

[ripat]

Non, tu dois mettre le code awk dans un fichier séparé comme dans mon post plus haut. Par exemple a.awk

Il ne doit pas nécessairement être exécutable. Ensuite tu invoaque l'interpréteur awk comme ceci:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

$ awk -f a.awk f2 f1

Attention à l'ordre de f1 et f2!

si tu veux l'intégrer dans un script bash plus large, tu peux faire:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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fichierDist=/udd/me/test/fichierDist.txt;
fichierRayo=/udd/me/test/fichierRay.txt;
awk 'NR==FNR {
	a[$1]=$2
	next
}
 
{
	d=a[$1]+a[$2]-$3
	s=d<=0 \
		? d==0 \
			? "sont limite" \
			: "ne se chevauchent pas et sont distants de avec une distance de: " (-1*d) \
		: "se chevauchent avec une distance de: " d
	print $1, $2, s
}' $fichierRayo $fichierDist

Tu parles de 'set -o errexit' ? Je ne vois pas le rapport

Je voulais dire l'option -e de sed.

[jack-ft]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

awk -f a.awk $fichierDist $fichierRayo

[code]awk: fatal: can't open source file `a.awk' for reading (No such file or directory)

Il faut mettre tout le code awk dans un fichier a.awk pour pouvoir lancer awk avec l'option -f

[BIG123]

ça marche
Merci bien pour votre aide