Discussion :

[utawalpa]

Bonjour,

j'ai cherché un bon moment sur internet sans pouvoir trouver de solution.

Voici mon problème. Avec Numpy je crée une matrice qu'on appellera M

avec

from vtk.util import numpy_support
vtkarray = numpy_support.numpy_to_vtk(M)

je passe ma matrice en Vtk Array (pas de problème et pas de message d'erreur)

print vtkArray me donne les bonnes informations.

J'aimerai exporter vtkarray dans un fichier vtk.

Les commandes VtkArrayDataWriter ou vtkarray.tofile ne sont pas reconnues.

Comment faire pour sauver mon vtkarray dans un fichier *.vtk ?

Merci

[utawalpa]

En bidouillant un exemple sur internet, j'ai trouvé un truc qui marche, voici la démarche :

installer evtk à partir de ce lien evtk.zip

De préférence :

• python 2.6 ou + (pas testé sur python 3)
• numpy 1.5 ou +
• cython
• pyvtk ? (dans le doute)
• paraview ou mayavi (idem çà peut pas faire de mal)

Le but sous python est de transformer une matrice 2D pouvant être interprétée comme une image, les indices représentant les pixels et la valeur aux indices une variable quelconque (dans mon cas une température issue d'un thermogramme)

Code python :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import numpy as np # Module mathématiques numpy
from evtk.hl import imageToVTK # Module d'exportation VTK
 
# création d'une matrice 2D type M[:,:] avec numpy
nc = 320    # nombre de pixel suivant x
nl = 256    # nombre de pixel suivant y
 
# Reshape de la 2D en 3D (avec une seule dimension en Z)
temp = M.reshape((1,nl,nc), order = 'C') 
 
# Création du nom du fichier
vtknomfic = "./image100" 		
# Sauvegarde la vtk image pour Paraview (format *.vti)			
imageToVTK(vtknomfic, cellData = {"temperature" : temp})

Dans mon cas, comme je fais une acquisition en fonction du temps, j'ai une matrice principale 3D (chaque matrice 2D en fonction du temps), que je peux directement ouvrir ensuite dans paraview, outil formidable ayant un python shell très appréciable à la fois pour la visualisation et le traitement des données. Et en plus c'est gratuit

Voilà, si quelqu'un à le même problème j'espère que cette astuce pourra lui servir !