Discussion :

[alaninho]

Bonjour,

j'aimerais modifier un fichier texte facilement.

Voici une partie du fichier à modifier :

/*_________________________________________________________

PEMSA : arbre

_________________________________________________________*/

\User declarations:

//Gap penalties
#define GOP -7
#define GEP -1
#define GTP -5
#define GOGP -10
#define NONE_SEQ -1 

//infoBackProp behavior
#define ADAPT 1
#define CREATE 0

//nodeFusion behavior
#define ROOT 1
#define NODE 0

//Children position
#define LEFT_C 0
#define RIGHT_C 1


//Definition des residus, ici AA
enum AA{C, S, T, P, A, G, N, D, E, Q, H, R, K, M, I, L, V, F, Y, W, GO, GE, GT };
#define AA_NUMBER 23 //20 AA + 3 Types de gap définis

//Problem dependant 
#define NB_SEQ 7
#define SIZE_ALG_SEQ 288 //72*4
#define GLOBAL_MAX_LENGTH 288 //72*5
#define TOTAL_RES 429

#define MAX_GAP 4
#define MAX_GAP_EXTENSION 10

J'aimerais modifier les lignes en rouge. Surtout les nombres. J'ai regardé sur le net mais j'ai du mal à l'adapter à mon problème.

Merci

Alaninho

[Invité]

Bonjour,

Pour ma part, je ferais ça à coup de grep et de sed. Est-ce la meilleure méthode / la plus rapide ? Je ne sais pas...

[Malinaka]

Oui j'approuve: sed est un outil sympa et polyvalent pour se genre de manoeuvre

Dans mes lointains souvenirs on pourrait aussi utiliser awk...

[N_BaH]

grep et sed

c'est redondant
sed sait faire correspondre des regex (voir man 7 regex) avec des lignes d'un fichiers.
sed est plus adapté pour ce type de substitution que awk.

pourquoi les lignes en rouges ?

[disedorgue]

Bonjour,

Pour ma part, je n'utiliserais ni sed, ni awk ou tout autre editeur de flux.
Ici, cela ressemble étrangement à du C et donc le compilateur peut ce charger de changer les valeurs en réécrivant chaque macro à modifier comme ceci par exemple:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
#ifndef NB_SEQ
#define NB_SEQ 7
#endif

coté compilateur, on peut ensuite définir une valeur comme ceci:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

gcc -DNB_SEQ=10 blabla

[Invité]

c'est redondant
sed sait faire correspondre des regex (voir man 7 regex) avec des lignes d'un fichiers.
sed est plus adapté pour ce type de substitution que awk.

pourquoi les lignes en rouges ?

J'y ai repensé hier soir et, effectivement, ça fait un peu double emploi. Autant pour moi ^^

[jack-ft]

J'aimerai modifier les lignes en rouge. Surtout les nombres.

Les modifier de quelle manière?

J'ai regardé sur le net mais j'ai du mal à l'adapter à mon problème.

Qu'as-tu essayé?

[alaninho]

Désolé pour ma réponse tardive, merci tous pour votre aide mais en faite j'ai opté pour du perl, étant dans la biologie, je devais analyse un fichier FASTA et perl si prête très bien.

Encore merci.

Alaninho