Discussion :

[Kinethe]

j'ai un bout de script qui me permet de traduire une chaine d'ADN en ARN (c'est-à-dire de convertir tous les T d'une chaine en U)

Voici le code:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#!/usr/bin/perl -w
 
use strict;
 
print "\nSaisie de la sequence ADN\n";
my $sequence = <STDIN>; 
 
sub Convertion
 
{
 
my ($sequence) =@_;
 
$sequence =~ tr/ATGCatgc/UACGuacg/;
print "\nLa sequence ARN est : $sequence\n";
}
Convertion ($sequence);

J e suis sous MAC OS et j'exécute ce script depuis un terminal. L e problèle est que dès que je saisie ( copie-colle) une séquence de plus de 1024 caractère la traduction n'a pas lieu alors que en dessous de 1024 caractères "tout se passe bien".

D'où vient ce pbl?
je pensais qu'en perl , il n'y avait pas de pbl de "taille".

[nyal]

Bonjour,

J e suis sous MAC OS et j'exécute ce script depuis un terminal. L e problèle est que dès que je saisie ( copie-colle) une séquence de plus de 1024 caractère la traduction n'a pas lieu alors que en dessous de 1024 caractères "tout se passe bien".

D'où vient ce pbl?
je pensais qu'en perl , il n'y avait pas de pbl de "taille".

Ca ne doit pas venir de perl mais plutot le buffer d'entree qui est limité. Je ne connais pas assez bien MAC OS pour te dire comment y remedier. Tu devrais passer par un fichier (en utilisant un pipe ou une redirection si le shell gere cela)

[Choupi]

Nyal a raison ca va vient de vette variable la :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

$ENV{'CONTENT_LENGTH'}

Je l'ai aussi à 1028...

Bout de code pratique :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

read (STDIN, $tampon, $ENV{'CONTENT_LENGTH'});

Voila, si tu veux plus, faut changer mais apres je suis pas sur que ce soit bien... > 1028 : passe par un fichier ou une redirection.

[nyal]

Nyal a raison ca va vient de vette variable la :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

$ENV{'CONTENT_LENGTH'}

Je l'ai aussi à 1028...

Bout de code pratique :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

read (STDIN, $tampon, $ENV{'CONTENT_LENGTH'});

Voila, si tu veux plus, faut changer mais apres je suis pas sur que ce soit bien... > 1028 : passe par un fichier ou une redirection.

A eviter pour la portabilite. Cette variable n'existe absolument pas sous Linux (et je pense que c'est la meme chose sous Mac OS).
Cett limitation vient surement plus du coté kernel.

[Choupi]

Hum, c'est d'une utilisation courante pour les CGI... donc je pense que c'est portable.

[Kinethe]

Excusez-moi ca devient très compliqué pour moi, ce que vous dites!

Tu devrais passer par un fichier (en utilisant un pipe ou une redirection si le shell gere cela)

et je ne comprends pas non plus ce que me dit de faire choupi

est-ce que vous pouvez me le détaillez un pe plus....

merci :o

[Choupi]

Soit tu ouvres ton fichier dans ton script...
Soit tu fais une redirection perl tonscript.pl < tonfichier

Tu es sous quel os ?

[Kinethe]

mac os 10
mais c'est quoi une redirection?

[Choupi]

Soit tu fais une redirection perl tonscript.pl < tonfichier

Ben c'est juste ca < > << >> ou le pipe |