Discussion :

[mydoudouitsk]

Bonjour,

Je cherche une fonction simple pour supprimer des lignes contenant des NA dans une colonne précise. Je ne veux pas supprimer ma ligne complète. Et j'ai beau tout tenter avec -which, na.omit etc. je n'y arrive pas.

Pourriez-vous m'aider?

Merci

[Sengar]

Ce que tu essayes de faire n'est pas possible.
Ou tu supprimes toute la ligne, ou tu laisses ta colonne avec des NA, valeurs vides ("") ou autre, mais toutes les colonnes de ton tableau doivent avoir la même longueur, ça parait logique.

En gros, si tu pars de ça :

	a	b	c
1	1	2	4
2	2	NA	3
3	3	3	5

Tu vas avoir un problème si tu ne supprimes pas toute la ligne là où il y a un NA (exemple bidon pas réalisable):

	a	b	c
1	1	2	4
2	2	3	3
3	3		5

-> Ceci n'est pas un tableau valable ^^

[Eva.D]

Bonjour,
Peut-être que la réponse précédente est suffisante, mais si ce que vous souhaitez est de ne filtrer les NA que selon une colonne vous pouvez utiliser "complete.cases" :
Imaginons que vous avez le data.frame suivant (appelé "data") :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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data
       a  b  c
 [1,]  1  1  1
 [2,]  2  2 NA
 [3,]  3  5  5
 [4,]  4  4  4
 [5,]  5 NA 27
 [6,]  6  5  5
 [7,]  7  4  4
 [8,]  8 NA 64
 [9,]  9 NA NA
[10,] 10 45 NA

et que vous souhaitiez supprimer les lignes correspondant à des valeurs de NA dans la colonne 3 :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

data2<-data[complete.cases(data[,3]),]

et vous obtenez :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
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5
6
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8
9
data2
     a  b  c
[1,] 1  1  1
[2,] 3  5  5
[3,] 4  4  4
[4,] 5 NA 27
[5,] 6  5  5
[6,] 7  4  4
[7,] 8 NA 64

Cela résoudrait-il votre problème ?

[mydoudouitsk]

Oh merci c'est exactement ce que je voulais

[arnaud de Coninck]

Bonjour,
Peut-être que la réponse précédente est suffisante, mais si ce que vous souhaitez est de ne filtrer les NA que selon une colonne vous pouvez utiliser "complete.cases" :
Imaginons que vous avez le data.frame suivant (appelé "data") :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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data
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 [1,]  1  1  1
 [2,]  2  2 NA
 [3,]  3  5  5
 [4,]  4  4  4
 [5,]  5 NA 27
 [6,]  6  5  5
 [7,]  7  4  4
 [8,]  8 NA 64
 [9,]  9 NA NA
[10,] 10 45 NA

et que vous souhaitiez supprimer les lignes correspondant à des valeurs de NA dans la colonne 3 :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

data2<-data[complete.cases(data[,3]),]

et vous obtenez :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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2
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6
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data2
     a  b  c
[1,] 1  1  1
[2,] 3  5  5
[3,] 4  4  4
[4,] 5 NA 27
[5,] 6  5  5
[6,] 7  4  4
[7,] 8 NA 64

Cela résoudrait-il votre problème ?

Bonjour,

est-ce qu'il y aurait un moyen de supprimer les NA et garder les lignes correspondantes, en les remplaçant par quelque chose d'autre pour que les colonnes du tableau gardent la même longueur. Le but serait de pouvoir faire un graphique ensuite avec toutes le lignes, mêmes celles ou il y avait des NA

[Eva.D]

Bonjour,

est-ce qu'il y aurait un moyen de supprimer les NA et garder les lignes correspondantes, en les remplaçant par quelque chose d'autre pour que les colonnes du tableau gardent la même longueur. Le but serait de pouvoir faire un graphique ensuite avec toutes le lignes, mêmes celles ou il y avait des NA

Bonjour,
Je ne suis pas sûre d'avoir bien compris ce que vous vouliez faire
S'il s'agit de remplacer tous les NA par la même valeur (ici 0) :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

data[is.na(data)]<-0

Vous pouvez aussi effectuer cette action sur une seule colonne

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

data[is.na(data[,1])]<-0

[arnaud de Coninck]

Bonjour,

merci pour votre réponse, c'est vrai que mon message n'est pas trop clair. En fait j'ai le tableau suivant, avec des concentrations d'élément en fonction de la profondeur (composite depth et les années. Une année correspond à une épaisseur, ex: 2005 va de 2.7mm à 3.0mm, 2006: de 2.5 à 2.6, etc..

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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composite.depth year          Al          Si           P           S          Cl          K         Ca
30             3.0 2005 0.000836473 0.011320262 0.000724943 0.000474001 0.000948002 0.08141666 0.04173998
29             2.9   NA 0.000788350 0.011431082 0.000000001  0.000478641 0.000000001 0.08390301 0.04088160
28             2.8   NA 0.000486832 0.011368954 0.000429557 0.001202761 0.000000001 0.08407871 0.04218254
27             2.7   NA 0.001778258 0.011427495 0.001457589 0.001428437 0.000320670 0.08847563 0.04358190
26             2.6 2006 0.000943874 0.011709934 0.000737401 0.001002866 0.000707905 0.09185071 0.04471602
25             2.5   NA 0.000954130 0.012850939 0.001222479 0.001043580 0.000327982 0.09135795 0.04400925
24             2.4 2007 0.001773155 0.014816366 0.000601070 0.000270481 0.000270481 0.09740333 0.04375787
23             2.3 2008 0.001413935 0.013327093 0.000631758 0.001263517 0.000722010 0.09744120 0.04527601
22             2.2   NA 0.002365972 0.013194846 0.001880645 0.001122320 0.000970655 0.09994717 0.04783511
21             2.1 2009 0.000520058 0.013674457 0.000703607 0.001193073 0.000397691 0.10486810 0.04894660
20             2.0   NA 0.002613637 0.013529415 0.001291444 0.000707219 0.000000000 0.10577543 0.04393985
19             1.9 2010 0.001398783 0.014236505 0.001305531 0.000341925 0.000279757 0.10055698 0.04441914
18             1.8   NA 0.001663461 0.012209176 0.001757619 0.000784651 0.000345247 0.10122003 0.04485068
17             1.7   NA 0.002276676 0.012015792 0.001644266 0.001833989 0.000126482 0.09565203 0.04382602
16             1.6 2011 0.001560828 0.011403604 0.000700780 0.000509658 0.000000001 0.09498756 0.04179198
15             1.5   NA 0.001148499 0.011772119 0.000000001 0.000957083 0.000000001 0.09436836 0.04361107
14             1.4   NA 0.000477181 0.010847924 0.000954363 0.001495168 0.000000001 0.09457736 0.04138753
13             1.3   NA 0.001552920 0.008461829 0.001362766 0.001521228 0.000348615 0.08686844 0.04211899
12             1.2   NA 0.000000001 0.008822382 0.000632429 0.000822157 0.000221350 0.08793922 0.03902086
11             1.1   NA 0.000603871 0.008454197 0.000572088 0.000540306 0.000000000 0.08228539 0.03912450
10             1.0   NA 0.001509006 0.008824402 0.000852916 0.001115352 0.000000000 0.07932120 0.03526480
9              0.9   NA 0.000581450 0.007798265 0.001265508 0.001128696 0.000684058 0.08191599 0.03481857
8              0.8   NA 0.001223572 0.006693659 0.000863698 0.001547459 0.000000000 0.07589745 0.03382817
7              0.7   NA 0.001598099 0.006638259 0.000491723 0.001352238 0.000000000 0.06007214 0.02950337
6              0.6   NA 0.001126383 0.005091252 0.001306604 0.001621992 0.000000000 0.05158835 0.02766397
5              0.5   NA 0.000786997 0.004259042 0.001527700 0.003518339 0.000462939 0.04184971 0.02615607
4              0.4   NA 0.000321730 0.002849606 0.001103073 0.002252108 0.000000000 0.02633588 0.02132609
3              0.3   NA 0.000000000 0.000246960 0.000905521 0.003416285 0.000370441 0.01382978 0.01572314
2              0.2   NA 0.000000000 0.000436172 0.001490256 0.002471643 0.000327129 0.01064988 0.01501160
1              0.1   NA 0.000000000 0.000000000 0.001260379 0.002588886 0.000000000 0.01076432 0.01454545

Si je veux tracer les concentrations en fonction des années ça ne marche pas à cause des NA. J'ai essayer en les remplaçant par 0, mais le graph n'est pas bon.
ce que je viens de faire, c'est de remplacer les NA par leurs années correspondantes dans une nouvelle colonne,

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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composite.
depth year	year_full	Al	Si	P	S	Cl	K	Ca
3	2005	2005	0.000836473	0.011320262	0.000724943	0.000474001	0.000948002	0.08141666	0.04173998
2.9	NA	2005	0.00078835	0.011431082	0.000000001	0.000478641	0.000000001	0.08390301	0.0408816
2.8	NA	2005	0.000486832	0.011368954	0.000429557	0.001202761	0.000000001	0.08407871	0.04218254
2.7	NA	2005	0.001778258	0.011427495	0.001457589	0.001428437	0.00032067	0.08847563	0.0435819
2.6	2006	2006	0.000943874	0.011709934	0.000737401	0.001002866	0.000707905	0.09185071	0.04471602
2.5	NA	2006	0.00095413	0.012850939	0.001222479	0.00104358	0.000327982	0.09135795	0.04400925
2.4	2007	2007	0.001773155	0.014816366	0.00060107	0.000270481	0.000270481	0.09740333	0.04375787
2.3	2008	2008	0.001413935	0.013327093	0.000631758	0.001263517	0.00072201	0.0974412	        0.04527601
2.2	NA	2008	0.002365972	0.013194846	0.001880645	0.00112232	0.000970655	0.09994717	0.04783511
2.1	2009	2009	0.000520058	0.013674457	0.000703607	0.001193073	0.000397691	0.1048681	1      0.0489466
2	NA	2009	0.002613637	0.013529415	0.001291444	0.000707219	0.000000001	0.10577543	0.04393985
1.9	2010	2010	0.001398783	0.014236505	0.001305531	0.000341925	0.000279757	0.10055698	0.04441914
1.8	NA	2010	0.001663461	0.012209176	0.001757619	0.000784651	0.000345247	0.10122003	0.04485068
1.7	NA	2010	0.002276676	0.012015792	0.001644266	0.001833989	0.000126482	0.09565203	0.04382602
1.6	2011	2011	0.001560828	0.011403604	0.00070078	0.000509658	0.000000001	0.09498756	0.04179198
1.5	NA	2011	0.001148499	0.011772119	0.000000001	0.000957083	0.000000001	0.09436836	0.04361107
1.4	NA	2011	0.000477181	0.010847924	0.000954363	0.001495168	0.000000001	0.09457736	0.04138753
1.3	NA	2011	0.00155292	0.008461829	0.001362766	0.001521228	0.000348615	0.08686844	0.04211899
1.2	NA	2011	0.000000001	0.008822382	0.000632429	0.000822157	0.00022135	0.08793922	0.03902086
1.1	NA	2011	0.000603871	0.008454197	0.000572088	0.000540306	0.000000001	0.08228539	0.0391245
1	NA	2011	0.001509006	0.008824402	0.000852916	0.001115352	0.000000001	0.0793212	0.0352648
0.9	NA	2011	0.00058145	0.007798265	0.001265508	0.001128696	0.000684058	0.08191599	0.03481857
0.8	NA	2011	0.001223572	0.006693659	0.000863698	0.001547459	0.000000001	0.07589745	0.03382817
0.7	NA	2011	0.001598099	0.006638259	0.000491723	0.001352238	0.000000001	0.06007214	0.02950337
0.6	NA	2011	0.001126383	0.005091252	0.001306604	0.001621992	0.000000001	0.05158835	0.02766397
0.5	NA	2011	0.000786997	0.004259042	0.0015277	11     0.003518339	0.000462939	0.04184971	0.02615607
0.4	NA	2011	0.00032173	0.002849606	0.001103073	0.002252108	0.000000001	0.02633588	0.02132609
0.3	NA	2011	0.000000001	0.00024696	0.000905521	0.003416285	0.000370441	0.01382978	0.01572314
0.2	NA	2011	0.000000001	0.000436172	0.001490256	0.002471643	0.000327129	0.01064988	0.0150116
0.1	NA	2011	0.000000001	0.000000001	0.001260379	0.002588886	0.000000001	0.01076432	0.01454545

Voici le script, ça peut aider certain: (xrf3 étant ma table)

Code :

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# On initialise une colonne qui va contenir la même information que la colone Year, mais sans les NA 
xrf2$year_full <- NA
 
# On remplit ensuite cette colonne élément par élément 
tmp <- NA # tmp va être la valeur que l'on va attribuer en position i 
 
for (i in 1:n) { 					
		if ( ! is.na(xrf3$year[i])) tmp <- xrf3$year[i] # dès que l'on rencontre quelque chose qui n'est pas NA dans la colonne Varves, on remplace tmp par cette valeur : 
		xrf3$year_full[i] <- tmp                        #cela arrive par exemple quand i vaut 1 ! 
		}

maintenant je n'arrive toujours pas à avoir le graph que je veux, mais ça c'est un autre sujet, je vais ouvrir une autre discussion.
Bonne journée
ADC