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function LireEtProfil(nom)
% nom est le le nom du fichier .nc (sans l'extension) que l'on veut lire
% il doit être entre cottes
file=[nom,'.nc']
d=datenum('01/01/2003',23):datenum('31/01/2003',23); % tous les jours entre les deux dates.
for n=1:numel(d)
filename=datestr(d(n),26); % date en yyyy/mm/dd
filename=[strrep(filename,'/','') '.nc']; %date en yyyymmdd + ".nc"
SuspMatt1=nc_varget(file,'suspended_matters');
chlorophyll_a1=nc_varget(file,'chlorophyll_a');
RejFlag1=nc_varget(file,'rejection_flag');
lon1=nc_varget(file,'lon');
lat1=nc_varget(file,'lat');
% Sélection de la zone d'intérêt
[SuspMatt,lon,lat]=SelectZoneDefaut(SuspMatt1,lon1,lat1);
[chlorophyll_a,lon,lat]=SelectZoneDefaut(chlorophyll_a1,lon1,lat1);
[RejFlag,lon,lat]=SelectZoneDefaut(RejFlag1,lon1,lat1);
Nlon=size(SuspMatt,2)
Nlat=size(SuspMatt,1)
% RejFlag = 1 pour la terre et 0 pour le reste
RejFlag=RejFlag.*(RejFlag==1);
% Figure matière en suspension
fig=figure;
set(fig,'DoubleBuffer','on','Position',[50 50 600 600]);
niveaux=[0,0,1,0.5,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,15,20,25,30,35,40,45,50];
[C,h]=contourf(lon,lat,SuspMatt,niveaux,'Color','k');
caxis([0 30])
clabel(C,h,'FontSize',6,'Color','k','BackgroundColor',[1 1 1],'EdgeColor',[1 1 1],'Rotation',0)
colormap(jet(128));
colorbar
axis equal
axis([-2.1 -1.4 43.4 44.2])
hold on
contourf(lon,lat,1000*RejFlag, [1000 1000],'LineColor','k');%,'LineWidth',2);
hold off
title('Niveaux de matière en suspension')
saveas(gcf,strrep(filename,'.nc','MES.bmp'),'bmp'); %date en yyyymmdd + "MES.bmp"
% saveas(gcf,'mes','bmp')
% Figure Chlorophylle a
fig2=figure;
set(fig2,'DoubleBuffer','on','Position',[50 50 600 600]);
niveaux=[0,0,1,0.5,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,15,20,25,30,35,40,45,50];
[C,h]=contourf(lon,lat,chlorophyll_a,niveaux,'Color','k');
caxis([0 30])
clabel(C,h,'FontSize',6,'Color','k','BackgroundColor',[1 1 1],'EdgeColor',[1 1 1],'Rotation',0)
colormap(jet(128));
colorbar
axis equal
axis([-2.1 -1.4 43.4 44.2])
hold on
contourf(lon,lat,1000*RejFlag,[1000 1000],'LineColor','k');
hold off
title('Niveaux de chlorophylle a')
saveas(gcf,strrep(filename,'.nc','CHL.bmp'),'bmp'); %date en yyyymmdd + "CHL.bmp"
%saveas(gcf,'chlorophylle','bmp')
end |
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