Discussion :

[ImagingAllthe]

Bonjour,
j'ai une question concernant les structures.

je cherche a charger un fichier .Mat contenant une structure, modifier un paramètre de la structure.
et resauver l'ensemble de la structure sous un autre nom en .mat

Avec ce code, je ne sauve pas toute la structure.

Code :

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S=load(strcat(local,'\',name,'.mat'));
S=setfield(S,var,newname);
NOM=strcat(local,'\',name,'_.mat')
save(NOM,'-struct','S');

Merci pour votre aide
ImagingAll

[Caro-Line]

Ben non avec cette forme de SAVE tu sauves les champs de la structure, c'est normal.
Enlève l'option '-struct' si c'est la variable S (donc la structure) que tu veux sauver.

[ImagingAllthe]

je veux sauver tous le .mat avec l'ensemble de la structure.
en retirant
ImagingAll

tout mon code

function [f] = OutputDir(name,var,newname)
local=pwd;
S=load(strcat(local,'\',name,'.mat'));
S=setfield(S,var,newname);
NOM=strcat(local,'\',name,'_.mat')
save(NOM,'-struct','S');

Le fichier de depart fait 50 Mo et le final 13 Mo
J'en deduit qu'il n'y a pas tout.

[mr_samurai]

salut,

t'as compris l'aide de Caro ?

Code :

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save(NOM,'S');  % Sauver la variable
 
% et pas : 
 
save(NOM,'-struct','S'); % sauver la structure (sans données)

++

[ImagingAllthe]

oui, j'ai mal recopié

mon code est

function [f] = OutputDir(name,var,newname)
name;
local=pwd;
S=load(strcat(local,'\',name,'.mat'));
S=setfield(S,var, newname);
NOM=strcat(local,'\',name,'_.mat')
save(NOM,'S');

je pense que 2eme S écrase le premier ...

Coment faire pour sauvegarder le tout sous un autre fichier .mat ?

[Caro-Line]

Relis bien les aides de LOAD et SAVE.
Je pense que tu mélanges un peu tout.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

S=load('fichier.mat');

Crée la structure S avec pour champs toutes les variables enregistrées dans le fichier fichier.mat.
Est-ce bien ce que tu souhaites faire ?
Parce que dans ton 1er post tu dis :

je cherche a charger un fichier .Mat contenant une structure

Si ton fichier contient une structure qui s'appelle S elle sera donc dans S.S...

Pourrais-tu éventuellement nous donner un exemple de ce que tu veux faire, ce serait plus simple.

[ImagingAllthe]

Bonjour,

une interface graphique ( Cellprofiler )permet de générer des .mat a exécuter en traitement de l'image.
Ces .mat sont générés a partir de compte windows et on souhaite les faire tourner sous linux.

Il existe un certain nombre de parametre à changer, dont la localisation des images.

Je souhaite changer le parametre de localisation des images dans le .mat et genéré le meme .mat avec un changement uniquement dans le .mat.

Je lance mon .m :

function [f] = OutputDir(name,var,newname)
name;
local=pwd;

Avec un Point d''arret ici

Code :

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OutputDir('Batch_data','DefaultImageDirectory','data/master/')
4   S=load(strcat(local,'\',name,'.mat'));
K>> whos
  Name         Size            Bytes  Class    Attributes
 
  local        1x23               46  char               
  name         1x10               20  char               
  newname      1x12               24  char               
  var          1x21               42  char               
 
K>> S=load(strcat(local,'\',name,'.mat'));
K>> whos
  Name         Size               Bytes  Class     Attributes
 
  S            1x1             55362012  struct              
  local        1x23                  46  char                
  name         1x10                  20  char                
  newname      1x12                  24  char                
  var          1x21                  42  char                
 
K>> S2=setfield(S,var, newname);
K>> whos
  Name         Size               Bytes  Class     Attributes
 
  S            1x1             55362012  struct              
  S2           1x1             55362160  struct              
  local        1x23                  46  char                
  name         1x10                  20  char                
  newname      1x12                  24  char                
  var          1x21                  42  char

Fin du code

S=load(strcat(local,'\',name,'.mat'));
S2=setfield(S,var, newname);
NOM=strcat(local,'\',name,'_.mat')
save(NOM,'S');

ImagingAll

[Caro-Line]

J'y comprends encore moins...
Veux-tu :
- Créer/Modifier le champ DefaultImageDirectory avec la valeur 'data/master/' dans la structure S (qui a comme champs les variables contenues au départ dans ton fichier .mat) et enregistrer cette variable ?
- Créer la variable DefaultImageDirectory avec la valeur 'data/master/' et l'ajouter aux variables déjà existantes dans le fichier .mat ?

Sinon remarques :
Sur ton dernier code tu crées S2 que tu n'utilises pas.
Pour créer un chemin vers un fichier il est en général plus propre d'utiliser fullfile (multi-plateformes) :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

fichier=fullfile(local,[name,'.mat'])

[ImagingAllthe]

Mais si tu as finit par me comprendre.

Créer/Modifier le champ DefaultImageDirectory avec la valeur 'data/master/' dans la structure S (qui a comme champs les variables contenues au départ dans ton fichier .mat) et enregistrer cette variable ?

Enregistrer la variable modifié et le .mat dans un autre .mat

je sais que je en me sert pas de S2, mais c'est our changer la valeur de la variable sans ecraser l'ensemble du .mat que j'ai loadé ....

ImagingAll

[Caro-Line]

Enregistrer la variable modifié et le .mat dans un autre .mat

Euh...non toujours pas....on enregistre pas un .mat dans un .mat

je sais que je en me sert pas de S2, mais c'est our changer la valeur de la variable sans ecraser l'ensemble du .mat que j'ai loadé ....

Changer la variable S ne modifie en rien le fichier .mat de départ.
LOAD ne fait que lire les variables du fichier et les mettre dans la structure S
Un exemple (car vraiment j'ai l'impression qu'on ne se comprend pas du tout) :

Code :

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a=2;
save('toto.mat','a);%je sauvegarde la valeur a dans toto.mat
clear a
S=load('toto.mat');
%Pour récupérer ma valeur a je dois faire :
S.a

[EDIT] Sais-tu quelles variables tu as dans ton fichier de départ ?
sinon pour le savoir :

Code :

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whos('-file',lenomdufichier)