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Débutez Discussion :

Boucle sur les niveaux d'un facteur et extraction de données. [Fait]


Sujet :

Débutez

  1. #1
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    Par défaut Boucle sur les niveaux d'un facteur et extraction de données.
    Bonjour,

    Je suis un débutant en SAS et ma question pourra vous paraitre basique.
    Je voudrais savoir comment extraire des données réalisant une certaine condition et comment faire une boucle sur les niveaux d'un facteur directement.
    En R je tape:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    id<-paste(assays$Method,assays$Lab,assays$Assay,assays$Rep)#id est ma clé
    for(i in levels(facteurid))
       	{
                  essai<-assays[facteurid==i & assays$Incl==1 & !is.na(assays$Obs) ,]
                 }
    .
    Voila ce à quoi j'aimerais aboutir en SAS.
    Merci.

  2. #2
    Expert éminent sénior


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    Par défaut
    Bonjour,
    La plupart des utilisateurs de SAS n'étant pas des utilisateurs de R je te conseille de donner "l'algorithme" général de ta question pour obtenir des réponses.
    Par exemple : Dans ma table j'ai x variables et je veux à partir de ces variables obtenir ceci ....
    Fafabzh

  3. #3
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    Par défaut
    Je dispose d'un tableau avec 600 observations et 10 variables dont les 4 premieres constituent ma clé(donc un facteur).Je voudrais donc extraire chaque sous-tableau par rapport à cette clé.Autrement dit,pour chaque niveau du facteur clé j'aimerais avoir le sous-tableau correspondant a cette clé.

  4. #4
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    Par défaut
    Citation Envoyé par Sagittarius Voir le message
    Je dispose d'un tableau avec 600 observations et 10 variables dont les 4 premieres constituent ma clé(donc un facteur).Je voudrais donc extraire chaque sous-tableau par rapport à cette clé.Autrement dit,pour chaque niveau du facteur clé j'aimerais avoir le sous-tableau correspondant a cette clé.
    Et qu'est-ce que tu appelle "sous-tableau" ? Une table par facteur (avec les mêmes colonnes) ? Ou une table triée par facteur ? Ou juste le nombre d'enregistrements / les totaux ?

  5. #5
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    Par défaut
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    pour chaque niveau du facteur
    Tu veux parler de chaque modalité (chaque combinaison unique) de ta clé ?

    Pour chaque modalité de ta clé tu voudrais avoir une table SAS dont le nom reprenne la modalité ?

  6. #6
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    Par défaut
    Sagittarius a dit :
    Oui, je voudrais une table par facteur pour ensuite pouvoir faire une ANOVA dessus.Mon but est d'extraire une table pour chaque combinaison unique de ma clé.
    Pour moi ce n'est pas la bonne façon de traiter les données (tu vas créer la multitude des tables, sans parler du problème de choix de nom de ces tables). Mais la solution existe : trier la table, faire un étape data, et à chaque changement de facteur faire une instruction output pour changer la table de sortie.

  7. #7
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    Par défaut Code pour extraire mes données.
    J'aimerais bien connaître le code pour extraire mes données.Je suis débutant et je m'embrouille vite avec les run, quit...

  8. #8
    Expert éminent sénior


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    Par défaut
    Bonjour,
    Dans la FAQ SAS tu auras quelques pistes :
    http://business-intelligence.developpez.com/faq/sas/
    Peux-tu nous mettre ton code SAS pour que nous saisissions bien ton problème.
    PS : Pourquoi veux-tu créer une table pour chaque identifiant de clé .... si tu as 1000 lignes différentes selon ta clé composite (tes 4 variables) tu auras 1000 tables créées...., si c'est pour faire des stats tu as d'autres solutions.
    Fafabzh

  9. #9
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    Par défaut Code SAS
    Voici mon code pour le moment mais il est faux car je n'ai pas fait les calculs pour chaque clé mais pour l'ensemble de ma base de données d'un coup.Et je voudrais faire une anova pour chacune des modalités.
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    proc import
       datafile="C:/Program Files/R/data.txt"
       out=data dbms=tab
                    replace;
       getnames=yes;
     
    proc import 
       datafile="C:/Program Files/R/info.txt"
       out=info dbms=tab
                      replace;
       getnames=yes;
     
    proc SQL;
    delete from data
       where (obs=. OR incl=0);
       run;
    proc sort data=data;
    by Method Lab Assay Rep Prep Dose Block Row Obs Incl;
    run;
    proc sort data=info;
    by Method Lab Assay Rep Prep Assigned mg ml Dilstep;
    run;
     
    data data;
       set data;
       cDose=Dose;
       cle=Method||Lab||Assay||Rep;
    proc glm data=data;
     
       class  prep cdose block row;
       model Obs= Block Row Prep Dose Dose(Prep) Dose*Dose cDose*Prep /ss1;
       ods output OverallAnova=OverallAnova ModelAnova=ModelAnova;
       run;
     
    data Anova(keep = Source df SS ms Fvalue Probf);
       retain dfLin ssLin;
       set ModelAnova OverallAnova;
          if df>0 then output;
    	  if source='Dose*Dose' then do; dfLin=df; ssLin=SS; end;
          if source='Prep*cDose' then do; dfLin=dfLin+df; ssLin=ssLin+SS; end;
          if source='Error' then do; source='Non-Linearity'; Fvalue=(ssLin/dfLin)/ms; probf=1-Probf(Fvalue,dfLin,df); ss=ssLin; df=dfLin; ms=ss/df;
    	  if df>0 then output;
    	  end;
     
    	  ods select all;
    proc print data=Anova noobs;
    run;
     
    ods select none;

  10. #10
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    Par défaut
    Bonjour
    Une des solutions est de :
    créer une table de avec les clés.
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    proc sql;
    create table cle as
    select Method,Lab,Assay,Rep
    from DATA
    group by Method,Lab,Assay,Rep;
    quit;
    Mettre le programme dans une macro
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    %macro ma_macro(Method,Lab,Assay,Rep);
    DATA DATA;
       SET DATA;
       cDose=Dose;
       cle=Method||Lab||Assay||Rep;
    proc glm DATA=DATA;
     
       class  prep cdose block row;
       model Obs= Block Row Prep Dose Dose(Prep) Dose*Dose cDose*Prep /ss1;
       ods output OverallAnova=OverallAnova ModelAnova=ModelAnova;
       run;
     
     
     
    DATA Anova(keep = Source df SS ms Fvalue Probf);
       retain dfLin ssLin;
       SET ModelAnova OverallAnova;
          IF df>0 then output;
    	  IF source='Dose*Dose' then do; dfLin=df; ssLin=SS; end;
          IF source='Prep*cDose' then do; dfLin=dfLin+df; ssLin=ssLin+SS; end;
          IF source='Error' then do; source='Non-Linearity'; Fvalue=(ssLin/dfLin)/ms; probf=1-Probf(Fvalue,dfLin,df); ss=ssLin; df=dfLin; ms=ss/df;
    	  IF df>0 then output;
    	  end;
     
    	  ods SELECT ALL;
    proc print DATA=Anova noobs;
    run;
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    data _null_;
    set cle;
    call execute(   '%ma_macro('||Method||','||Lab||','||Assay||','||Rep||')' );

  11. #11
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    Par défaut Commande %Mend
    Merci de cette réponse qui me parait fort intéressante. Cependant SAS me dit qu'il manque la commande %MEND dans ce code. A quoi sert-elle? A quel endroit dois-je la mettre?
    Merci d'avance pour vos réponses.

  12. #12
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    Par défaut
    %MEND sert à fermé ta macro %MACRO.

    Voici la syntaxe :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    /* Compilation de la macro */
    %macro ma_macro(Method,Lab,Assay,Rep);
    ... code sas
    %mend:
     
    /* execution */
    %ma_macro(paramètres ...);

  13. #13
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    Par défaut Question.
    En faisant ainsi je n'ai toujours pas le résultat voulu. SAS me fait toujours l'ANOVA sur toutes mes observations et non pas selon les différentes clés contenues dans ma table.
    Voici mon code:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    proc import
       datafile="C:/Program Files/R/fichierdata.txt"
       out=fichierdata dbms=tab
                    REPLACE;
       getnames=yes;
     
    proc import 
       datafile="C:/Program Files/R/fichierinfo.txt"
       out=fichierinfo dbms=tab
                      REPLACE;
       getnames=yes;
     
    proc SQL;
    DELETE FROM fichierdata
       WHERE (obs=. OR incl=0);
       run;
    proc sort DATA=fichierdata;
    BY Method Lab Assay Rep Prep Dose Block Row Obs Incl;
    run;
    proc sort DATA=fichierinfo;
    BY Method Lab Assay Rep Prep Assigned mg ml Dilstep;
    run;
    proc sql;
    CREATE TABLE cle AS
    SELECT Method,Lab,Assay,Rep
    FROM fichierdata
    GROUP BY Method,Lab,Assay,Rep;
    quit;
    %macro ma_macro(Method,Lab,Assay,Rep);
    DATA fichierdata;
       SET fichierdata;
       cDose=Dose;
     
    proc glm DATA=fichierdata;
     
       class  prep cdose block row;
       model Obs= Block Row Prep Dose Dose(Prep) Dose*Dose cDose*Prep /ss1;
       ods output OverallAnova=OverallAnova ModelAnova=ModelAnova;
       run;
     
     
     
    DATA Anova(keep = Source df SS ms Fvalue Probf);
       retain dfLin ssLin;
       SET ModelAnova OverallAnova;
          IF df>0 then output;
    	  IF source='Dose*Dose' then do; dfLin=df; ssLin=SS; end;
          IF source='Prep*cDose' then do; dfLin=dfLin+df; ssLin=ssLin+SS; end;
          IF source='Error' then do; source='Non-Linearity'; Fvalue=(ssLin/dfLin)/ms; probf=1-Probf(Fvalue,dfLin,df); ss=ssLin; df=dfLin; ms=ss/df;
    	  IF df>0 then output;
    	  end;
     
    	  ods SELECT ALL;
    proc print DATA=Anova noobs;
    run;
    %MEND;
    %ma_macro(||Method||','||Lab||','||Assay||','||Rep||);
    run;

  14. #14
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    Par défaut
    L'appel se fait de la manière suivante
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    DATA _null_;
    SET cle;
    call execute(   '%ma_macro('||Method||','||Lab||','||Assay||','||Rep||')' );
    run;
    et non
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    3
     
    %ma_macro(||Method||','||Lab||','||Assay||','||Rep||);
    run;

  15. #15
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    Par défaut
    Bonjour,
    Pour l'utilisation des macro, la FAQ pourra t'aider
    http://business-intelligence.develop.../sas/?page=1#9

  16. #16
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    Par défaut Remarque.
    Même de cette manière le résultat attendu n'est pas le bon. SAS fait toujours l'ANOVA sur toutes mes données et non pas sur chacune des modalités de ma clé. Le code est maintenant le suivant:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    proc import
       datafile="C:/Program Files/R/fichierdata.txt"
       out=fichierdata dbms=tab
                    REPLACE;
       getnames=yes;
     
    proc import 
       datafile="C:/Program Files/R/fichierinfo.txt"
       out=fichierinfo dbms=tab
                      REPLACE;
       getnames=yes;
     
    proc SQL;
    DELETE FROM fichierdata
       WHERE (obs=. OR incl=0);
       run;
    proc sort DATA=fichierdata;
    BY Method Lab Assay Rep Prep Dose Block Row Obs Incl;
    run;
    proc sort DATA=fichierinfo;
    BY Method Lab Assay Rep Prep Assigned mg ml Dilstep;
    run;
    proc sql;
    CREATE TABLE cle AS
    SELECT Method,Lab,Assay,Rep
    FROM fichierdata
    GROUP BY Method,Lab,Assay,Rep;
    quit;
    %macro ma_macro(Method,Lab,Assay,Rep);
    DATA fichierdata;
       SET fichierdata;
       cDose=Dose;
     
    proc glm DATA=fichierdata;
     
       class  prep cdose block row;
       model Obs= Block Row Prep Dose Dose(Prep) Dose*Dose cDose*Prep /ss1;
       ods output OverallAnova=OverallAnova ModelAnova=ModelAnova;
       run;
     
     
     
    DATA Anova(keep = Source df SS ms Fvalue Probf);
       retain dfLin ssLin;
       SET ModelAnova OverallAnova;
          IF df>0 then output;
    	  IF source='Dose*Dose' then do; dfLin=df; ssLin=SS; end;
          IF source='Prep*cDose' then do; dfLin=dfLin+df; ssLin=ssLin+SS; end;
          IF source='Error' then do; source='Non-Linearity'; Fvalue=(ssLin/dfLin)/ms; probf=1-Probf(Fvalue,dfLin,df); ss=ssLin; df=dfLin; ms=ss/df;
    	  IF df>0 then output;
    	  end;
     
    	  ods SELECT ALL;
    proc print DATA=Anova noobs;
    run;
    %MEND;
    DATA _null_;
    SET cle;
    call execute(   '%ma_macro('||Method||','||Lab||','||Assay||','||Rep||')' );
    run;

  17. #17
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    Est ce que je peux avoir les fichiers en entrée?
    pour faire les tests

  18. #18
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    Par défaut Fichier.
    Voici le fichier fichierdata. Dans ce cas-ci j'ai donc 2 modalités pour ma clé qui est je le rappelle Lab,Method,Assay,Rep.
    Lab Method Assay Rep Prep Dose Block Row Obs Incl
    1 2 1 1 1 1 1 1 19 1
    1 2 1 1 1 1 2 1 18 1
    1 2 1 1 1 1 3 1 15 1
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    1 2 1 1 1 1 5 1 13 1
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    1 2 1 1 1 1 9 1 12 1
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    1 2 1 1 1 1 12 1 20 1
    1 2 1 1 1 2 1 1 20 1
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    1 2 2 1 1 3 5 1 . 1
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    1 2 2 1 2 3 6 1 12 1
    1 2 2 1 2 3 13 1 13 1
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    1 2 2 1 2 3 15 1 14 1
    1 2 2 1 2 3 16 1 15 1
    1 2 2 1 2 3 17 1 12 1
    1 2 2 1 2 3 18 1 13 1
    1 2 2 1 3 1 7 1 19 1
    1 2 2 1 3 1 8 1 20 1
    1 2 2 1 3 1 9 1 20 1
    1 2 2 1 3 1 10 1 21 1
    1 2 2 1 3 1 11 1 22 1
    1 2 2 1 3 1 12 1 25 1
    1 2 2 1 3 1 13 1 15 1
    1 2 2 1 3 1 14 1 13 1
    1 2 2 1 3 1 15 1 21 1
    1 2 2 1 3 1 16 1 18 1
    1 2 2 1 3 1 17 1 19 1
    1 2 2 1 3 1 18 1 . 1
    1 2 2 1 3 2 7 1 . 1
    1 2 2 1 3 2 8 1 20 1
    1 2 2 1 3 2 9 1 21 1
    1 2 2 1 3 2 10 1 22 1
    1 2 2 1 3 2 11 1 21 1
    1 2 2 1 3 2 12 1 12 1
    1 2 2 1 3 2 13 1 14 1
    1 2 2 1 3 2 14 1 18 1
    1 2 2 1 3 2 15 1 13 1
    1 2 2 1 3 2 16 1 14 1
    1 2 2 1 3 2 17 1 19 1
    1 2 2 1 3 2 18 1 22 1
    1 2 2 1 3 3 7 1 20 1
    1 2 2 1 3 3 8 1 12 1
    1 2 2 1 3 3 9 1 16 1
    1 2 2 1 3 3 10 1 14 1
    1 2 2 1 3 3 11 1 18 1
    1 2 2 1 3 3 12 1 21 1
    1 2 2 1 3 3 13 1 19 1
    1 2 2 1 3 3 14 1 22 1
    1 2 2 1 3 3 15 1 13 1
    1 2 2 1 3 3 16 1 15 1
    1 2 2 1 3 3 17 1 20 1
    1 2 2 1 3 3 18 1 21 1

  19. #19
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    J'aimerais avoir les deux fichiers sous format txt, pour exécuter le programme.
    fichierdata.txt et fichierinfo.txt

  20. #20
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    fichierinfo est inutile pour le moment. C'est juste pour la suite que j'en aurai besoin.

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