Discussion :

[DaMNeO]

Bonjour à tous,

je lance mon premier post avec un problème d'adaptation de la méthode Muench sur les attributs d'un noeud.

Je suis encore novice avec le XSLT mais pensais pourtant pouvoir m'en sortir comme un grand en adaptant le concept de groupement sur les noeuds, déjà bien relayé sur différents tutos de Grandfather ... Hé bien, NON !!

Voici un extrait allégé de mon fichier :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<REFERENCE databank="databank1" id="id1">truc bidule</REFERENCE>
<REFERENCE databank="databank3" id="id6">machin</REFERENCE>
<REFERENCE databank="databank2" id="id4">comment</REFERENCE>
...
<REFERENCE databank="databank1" id="id8">chose</REFERENCE>
<REFERENCE databank="databank2" id="id2">no idea</REFERENCE>

... que je voulais transformer en :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<ref_databank1>
     <id>id1</id>
     <id>id8</id>
     ...
</ref_databank1>
<ref_databank2>
     <id>id2</id>
     <id>id4>
     ...
</ref_databank2>
...

Je fais peut être fausse route; n'applique pas la bonne méthode ou pas correctement mais voici mon code qui en fait n'affiche que la liste des databank et non pas la liste des id correspondants.
En gros; mon code qui ne marche pas :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<?xml version="1.0"?>
 
<xsl:stylesheet xmlns:xsl="http://www.w3.org/1999/XSL/Transform" xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" version="1.0">
 
	<xsl:key name="databank" match="//REFERENCE" use="@databank"/>
	<xsl:key name="id" match="//REFERENCE" use="@id"/>
 
<xsl:template match="/ENTRY">
 
<ENTRY>
 
 
	<xsl:for-each select="//REFERENCE[generate-id(.)=generate-id(key('databank',@databank)[1])]">
		<xsl:sort select="@databank"/>
		<xsl:variable name="current_databank" select="@databank"/>
 
		<xsl:element name="ref_{$current_databank}">
 
		<xsl:for-each select="//REFERENCE[generate-id(.)=generate-id(key('id',@id)[preceding-sibling:://REFERENCE/@databank=$current_databank][1])]">
		<xsl:sort select="@id"/>
			<xsl:element name="id">
				<xsl:value-of select="@id"/>
			</xsl:element>		
		</xsl:for-each>
 
		</xsl:element>
	</xsl:for-each>
 
 
</ENTRY>
 
</xsl:template>
 
</xsl:stylesheet>

Voilà, en espérant avoir été clair. Pke mes neurones ne le sont plus trop.
Par avance, merci !

[GrandFather]

Bonjour,

tu n'étais pas très loin, il fallait juste poursuivre ton objectif de départ jusqu'au bout, travailler sur les attributs et non les éléments.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<xsl:key name="databank" match="//REFERENCE/@databank" use="."/>
...
<xsl:for-each select="//REFERENCE/@databank[generate-id()=generate-id(key('databank', .)[1])]">
...
<xsl:for-each select="key('databank', current())/../@id">

[DaMNeO]

YouUhOuu ça marche impec !

Super merci Grandfather !!
Pour avoir lu tes précédents posts sur le sujet; je me doutais bien que t'aurais ma réponse. Et de surcroit, très rapide

Visiblement, j'ai pas encore compris tous les concepts du XSLT.
Cependant, j'ai pu voir que le XSLT 2 était plus souple au niveau des regroupements, élimination doublons, etc. Ça mériterait peut être que je m'y attarde un peu prochainement.

Sinon, simple question; quelle est concrètement la différence entre

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<xsl:key name="databank" match="//REFERENCE/@databank" use="."/>

et

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<xsl:key name="databank" match="//REFERENCE" use="@databank"/>

Merci encore

[GrandFather]

Ils n'indexent tout simplement pas les mêmes noeuds ; la première indexe les attributs databank par leur contenu, tandis que la deuxième indexe les éléments REFERENCE par le contenu de leur attribut databank.

Effectivement, XSLT 2.0 permet de faire des regroupements bien plus facilement, sans utiliser la méthode Muench.

[DaMNeO]

Ok GrandFather. C'est maintenant clair.

Merci. Et sûrement à bientôt !

[DaMNeO]

Bonjour à tous,

Je relance mon post pour un souci similaire au précédent mais dans une configuration légèrement différente.

Puisqu'un exemple vaut mieux qu'un long discours; voici la partie du xml que je manipule :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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     <type value="mRNA">
          <db_xref db="Nucleotide" id="AK1"/>
          <db_xref db="Protein" id="AK2"/>
          <db_xref db="Nucleotide" id="AK3"/>
          ...
     </type>
 
     <type value="Genomic">
          <db_xref db="Protein" id="AK6"/>
          <db_xref db="Protein" id="AK4"/>
          <db_xref db="Nucleotide" id="AK5"/>
          ...
     </type>
 
     ...

Voilà en quoi je voulais le transformer :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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     <seq_mRNA>
 
          <Nucleotide_entry>
               <crossref>AK1</crossref>
               <crossref>AK3</crossref>
          </Nucleotide_entry>
 
          <Protein_entry>
               <crossref>AK2</crossref>
          </Protein_entry>
 
     </seq_mRNA>
 
 
     <seq_Genomic>
 
          <Nucleotide_entry>
               <crossref>AK5</crossref>
          </Nucleotide_entry>
 
          <Protein_entry>
               <crossref>AK4</crossref>
               <crossref>AK6</crossref>
          </Protein_entry>
 
     </seq_Genomic>
 
     ...

Malheureusement, par mon code qui suit (application de Muench toujours) :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<?xml version="1.0"?>
 
<xsl:stylesheet xmlns:xsl="http://www.w3.org/1999/XSL/Transform" xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" version="1.0">
 
     <xsl:key name="databank" match="//type/db_xref/@db" use="."/>
 
<xsl:template match="/ENTRY">
 
<ENTRY>
 
     <xsl:for-each select="//type">
          <xsl:variable name="type" select="@value"/>
 
          <xsl:element nam="seq_{$type}">
 
          <xsl:for-each select="./db_xref/@db[generate-id()=generate-id(key('databank', .)[1])]">
               <xsl:sort select="@db"/>
               <xsl:variable name="current_databank" select="@db"/>
 
               <xsl:element name="{$current_databank}_entry">
 
               <xsl:for-each select="key('databank', current())/../@id">
                    <crossref><xsl:value-of select="@id"/></crossref>
		</xsl:for-each>
 
		</xsl:element>
          </xsl:for-each>
          </xsl:element>
 
     </for-each> 
</ENTRY>
 
</xsl:template>
 
</xsl:stylesheet>

j'obtiens ceci :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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     <seq_mRNA>
 
          <Nucleotide_entry>
               <crossref>AK1</crossref>
               <crossref>AK3</crossref>
               <crossref>AK5</crossref>
          </Nucleotide_entry>
 
          <Protein_entry>
               <crossref>AK2</crossref>
               <crossref>AK4</crossref>
               <crossref>AK6</crossref>
          </Protein_entry>
 
     </seq_mRNA>
 
     </seq_Genomic>
     </seq_Other>
 
     ...

En gros, je regroupe bien les attributs comme GrandFather me l'a appris, cependant, je perds la notion d'ancêtres auxquels ils sont raccordés.

J'ai essayé également d'autres manières, en repassant par exemple le nom de l'attribut @db dans le path "type[@db=$type]/db_xref" ou dans la condition, mais en vain
Je ne vois pourtant pas de difficulté supplémentaire par rapport à mon post précédent...

Si quelqu'un tu pouvait m'expliquer de nouveau où se trouve mon erreur; il m'épargnerait quelques cellules grises

Merci

[DaMNeO]

Salut à tous

C'est bon, résolu comme un grand
La persévérance paie finalement.

Je lâche mon code; ça pourrait intéresser quelqu'un...

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<xsl:key name="db" match="//type/@value" use="."/>
<xsl:key name="type" match="//type/db_xref/@db" use="."/>
 
...
 
<xsl:for-each select="//type/@value[generate-id(.)=generate-id(key('type', .)[1])]">
 
     <xsl:variable name="type" select="."/>
 
     <xsl:element name="seq_{$type}">
 
     <xsl:for-each select="//db_xref/@db[generate-id(.)=generate-id(key('db',.)[ancestor::type/@value=$type][1])]">
          <xsl:variable name="current_databank" select="."/>
 
          <xsl:element name="{$current_databank}_entry">
 
          <xsl:for-each select="key('db',current())/../@id [ancestor::type/@value=$type]">
               <xsl:sort select="@id"/>
               <xsl:element name="crossref"><xsl:value-of select="."/></xsl:element>
          </xsl:for-each>
 
          </xsl:element>
     </xsl:for-each>
     </xsl:element>
</xsl:for-each>