Discussion :

[stansoad0108]

Bonjour à tous,

Je suis débutant en Java, j'ai crée un petit programme permettant de "parser" (utilisation des expressions régulière - pattern - matcher...) un fichier texte. J'ai crée des tableaux pour y pouvoir stocker les résultats...
Voila je ne sais pas comment faire pour mes mettre ces résultats dans les tableaux (initialement crées).

Code :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import java.io.BufferedReader;
import java.io.FileReader;
import java.io.IOException;
import java.io.File;
import java.util.regex.Matcher;
import java.util.regex.Pattern;
 
 
public class Ontology_PharmGKB {
 
	private static Pattern pattern;
	private static Matcher matcher;
 
        // Tableaux 
	String[] tab_Genes = null;
	String[] tab_Diseases = null;
	String[] tab_Drugs = null ;
 
	// Parsage d'un fichier sortie {Gene} dans PharmGKB
 
	private static void readFile(String fileName){
 
 
		try {
 
			File file = new File(fileName);
			FileReader reader = new FileReader(file);
			BufferedReader in = new BufferedReader(reader);
			String string;
 
			while ((string = in.readLine()) != null){
 
 
				// To find related Diseases
				pattern = Pattern.compile("(===> Diseases: (.+))");
				matcher = pattern.matcher(string);				
 
				if(matcher.find()){
					//System.out.println("Trouvé !");
					System.out.println(matcher.group(0));
					System.out.println("");
 
				}
 
				//To find related Drugs
				pattern = Pattern.compile("(===> Drugs: (.+))");
				matcher = pattern.matcher(string);
 
				if(matcher.find()){
					//System.out.println("Trouvé !");
					System.out.println(matcher.group(0));
					System.out.println("");
				}
 
			} // fin while
 
			in.close();
		} catch (IOException e){
			e.printStackTrace();
		}
	}
 
	public static void main (String [] args){
		if(args.length != 2){
			System.err.println("Usage : Java TextReader" + "file location");
			System.exit(0);
		}
		String ArgumentFile = new String("/home/.../" + args[0] + "_" + args[1] + "_PharmGKB_data.txt");
		readFile(ArgumentFile);
 
	}
 
 
}

Je voudrais savoir comment mettre le résultats en rapport avec DISEASE dans le tableau String[] tab_Diseases. Et ceux en rapport avec DRUGS dans le tableau String[] tab_Drugs.

MERCI BEAUCOUP

[Goupo]

Instanciation d'un tableau :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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int taille = 100;
String[] tableau = new String[taille];

Utilisation d'un tableau :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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for (int i = 0; i < tableau.length; i++) {
tableau[i] = "Cellule n°" + (i + 7);
System.out.println(tableau[i]);
}
System.out.println(tableau[4]);
System.out.println(tableau[10]);

L'intérêt de ce code est assez limité, mais tu peux y trouver la syntaxe.

Tu peux aussi créer un tableau de cette manière :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

String[] tab = {"salut", "hi", "hola", "hallo"};

[stansoad0108]

Merci

Mais quand tu dis :

L'intérêt de ce code est assez limité, mais tu peux y trouver la syntaxe.

Justement je n'arrive à trouver les bonnes variables pour qu'elle rentrent dans mes tableaux.

Ce que je récupére à l'aide de matcher.group(0), je voudrais que ca aille dans mon tableau, mais je ne sais pas comment faire...

Si quelqu'un pourrait m'aider à trouver
Merci

[Goupo]

Ca dépend de ce que retourne matcher.group(0)... En imaginant que c'est un int :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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int[] tableau = new int[100];
tableau[0] = matcher.group(0);

[stansoad0108]

D'accord !!

Dans mon matcher.group(0), j'ai plusieurs "Strings" à la suite délimités par un "/"
exemple : Hypercholesterolemia / Arteriosclerosis / HIV / Lipodystrophy /

Et je voudrais savoir comment on peut remplir notre tableau en faisant en sorte que :
Hypercholesterolemia = tab[0];
Arteriosclerosis = tab[1];
...
Lipodystrophy = tab[3]

Et je tiens à préciser que ce texte (Hypercholesterolemia / Arteriosclerosis / HIV / Lipodystrophy /) change tout le temps. J'effectue des requêtes sur des bases de données, donc le texte et la taille du tableau changeront...

Merci

[CyberChouan]

Tu n'as même pas besoin de créer le tableau toi-même. La méthode split de java fera ça très bien toute seule:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

String[] tableau = matcher.group(0).split("/");

[stansoad0108]

Bonjour,

C'est noté, mais quand je fais :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

System.out.println(String[] tableau);

Il m'inscrit dans la console :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

[Ljava.lang.String;@1f33675

J'ai même écrit au début de mon code : import java.lang.String; Donc je ne comprend pas pourquoi il m'inscrit ceci !

Merci pour vos commentaires

[stansoad0108]

C BON !!

Mon problème était dans la taille du tableau; j'ai limité sa taille, et ca fonctionne !!

Encore merci pour vos réactions !