Discussion :

[ema31]

Bonjour,

Voici mon souci :
Je dois intégrer du code Fortran à un programme Matlab. Pour celà, j'ai utilisé la fonction mex qui permet d'interfacer Fortran/matlab.
Je récupère donc un exécutable matlab(.mexglx car je bosse sous linux) que je peux lancer depuis ma console matlab. Jusque là tout va bien.

Problème : je dois pouvoir utiliser cette fonction dans un projet sur la machine d'une collègue

Dans la doc matlab, c'est écrit que ce .mexglx se comporte exactement comme un M-file mais quand j'essaie de l'exécuter sur la machine de ma collègue, j'obtiens un gros plantage matlab avec un segmentation fault (apparement, ça plante au lancement, lorsque le linkage dynamique s'effectue). Alors j'ai essayé toutes sortes de choses : placer les fichiers objets dans le même répertoire, fournir les sources etc... mais rien à faire toujours la même erreur !

Est-ce que quelqu'un sait comment partager une fonction créée avec un mex-file ??

Merci d'avance à tous ceux qui prendront du temps pour répondre à ma question.

[Jerome Briot]

Pourrais-tu nous montrer le message d'erreur complet (même si ça semble incompréhensible...)

Sinon, y-a-t-il des différences entre les deux machines (version de MATLAB, système d'exploitation...) ?

[ema31]

Merci de t'intéresser à mon problème.

Je bosse sour Linux (red hat 5) et elle, sa machine est sous red hat 4.
Pour ce qui est de la version de Matlab c'est exactement la même puisqu'on la récupère sur le même serveur. C'est la version 7.4.

Et l'erreur, la voici :

------------------------------------------------------------------------
Floating point exception detected at Wed Aug 27 17:13:21 2008
------------------------------------------------------------------------

Configuration:
MATLAB Version: 7.4.0.336 (R2007a)
MATLAB License: ****
Operating System: Linux 2.6.9-22.EL #1 Mon Sep 19 18:20:28 EDT 2005 i686
GNU C Library: 2.3.4 stable
Window System: The X.Org Foundation (60802000), display :0.0
Current Visual: 0x21 (class 4, depth 24)
Processor ID: x86 Family 15 Model 4 Stepping 7, GenuineIntel
Virtual Machine: Java 1.5.0 with Sun Microsystems Inc. Java HotSpot(TM) Client VM mixed mode
Default Charset: UTF-8

Register State:
eax = 0f4d007f ebx = 0095bfd4
ecx = 00000000 edx = 00000000
esi = 09f18fa8 edi = 00a8d2ee
ebp = bff81f84 esp = bff81f3c
eip = 0094e47c flg = 00010246

Stack Trace:
[0] ld-linux.so.2:0x0094e47c(0x00a8d120, 0xbff82014, 0x09f19100, 0)
[1] ld-linux.so.2:0x0094e822(0x09f19154, 0, 0, 1)
[2] ld-linux.so.2:0x0094fcc4(0x09f18fa8, 0x09f19154, 0, 0)
[3] libc.so.6:0x00a5e96a(0xbff82340, 0x09e8c7c4, 0xbff83654, 0xa6338cb0)
[4] ld-linux.so.2:0x0095207e(0xbff82340, 0x0941fb5c, 6, 0x44200000)
[5] libc.so.6:_dl_open~(0xfffffffe, 0xbff824e0, 0x0095bca0, 0x0095bfd4) + 152 bytes
[6] libdl.so.2:0x00ab4cb8(0xbff824e0, 0, 0, 0)
[7] ld-linux.so.2:0x0095207e(0xbff824e0, 0x00ab4f50, 0xb740b9f0 ", 0x00770de3)
[8] libdl.so.2:0x00ab52bb(2, 2, 2, 2)
[9] libdl.so.2:dlopen~(0x09ba451d "/home/******/Desktop/ema/scal..", 2, 0xbff82548, 0x0139ad00 ") + 65 bytes

This error was detected while a MEX-file was running. If the MEX-file
is not an official MathWorks function, please examine its source code
for errors. Please consult the External Interfaces Guide for information
on debugging MEX-files.

If it is an official MathWorks function, please
follow these steps to report this problem to The MathWorks so we
have the best chance of correcting it:

The next time MATLAB is launched under typical usage, a dialog box will
open to help you send the error log to The MathWorks. Alternatively, you
can send an e-mail to segv@mathworks.com with the following file attached:
/home/******/matlab_crash_dump.21902

If the problem is reproducible, please submit a Service Request via:
http://www.mathworks.com/support/con...request_1.html

A technical support engineer might contact you with further information.

Thank you for your help. Save your workspace and restart MATLAB.

[Jerome Briot]

As-tu essayé l'exécution pas à pas ?

=> Debugging Fortran Source MEX-Files

[ema31]

Après avoir bien galéré, nous avons trouvé une solution provisoire qui marche : retourner sous une ancienne version de matlab (r14.3), tout recompiler avec gfortran à la place de g95 et f95 et créer le mex-file directement sur la machine de ma collègue.

Ce n'est pas l'idéal... donc je vais continuer à chercher...

Mais, merci beaucoup en tous cas.

[paradize3]

je regarderais s'il n'y a pas quelques depassements d'indices dans les tableaux dans votre programme fortran....

Salutations,

Greg

[SeByDocKy]

Oui c'est assez courant comme problème. En fait, certains gardent des veillent versions de Matlab pour pouvoir distribuer des mexfiles qui fonctionneront sur les versions ultérieures.

Pourquoi ne recompilez-vous pas le mex file sur la machine de votre collègue ?. c'est la solution. Ca peut venir également d'options de compilation (optimisations par rapport à un type de processeur) liées à la premiere machine.