Proposition de stage de master (4 à 6 mois)

Sujet : Développement d’un logiciel de conception assistée par ordinateur pour la biologie synthétique

Contexte du stage
Le stage s’intègre dans un projet de biologie synthétique. La biologie synthétique est un nouveau domaine de recherche qui combine la biologie et les sciences de l’ingénieur, dans le but de concevoir et construire de nouvelles fonctions et de nouveaux systèmes biologiques. L'ambition du projet est d'identifier et produire des biomolécules capables de réaliser des tâches élémentaire réutilisables, et qui, combinées entre elles, effectueront des processus « programmés ». Ce travail a pour objectif final de tester, en culture cellulaire ou dans le colon, la présence de bio-marqueurs de surface cellulaire pour réaliser un diagnostic de cancer.

Description du stage
A partir d’approches développées au laboratoire, le stagiaire aura en charge le développement d’un outil bioinformatique pour la conception de réseaux biologiques synthétiques. Le stage permettra l’utilisation de diverses techniques : bases de données relationnelles (conception, maintenance), interfaces web (php, css), programmation Java (programmation objet, interfaces graphiques). Ces différentes techniques s’articuleront autour de l’intégration de logiciels existants.

Compétences souhaitées
Niveau Master 2 Informatique ou Bioinformatique
Maîtrise de Java et des bases de données relationnelles (langage SQL avec MySQL), maîtrise de php.
Connaissances en biologie utiles mais pas indispensables.

Lieu
Laboratoire SysDiag CNRS/Bio-Rad FRE3009
Modélisation et ingénierie de systèmes complexes biologiques pour le diagnostic
Cap Delta / Parc Euromédecine
1682, rue de la Valsière
CS 61003
34184 MONTPELLIER Cedex 4, France

Contact
Envoyer CV + lettre de motivation à
Stéphanie Rialle, stephanie.rialle@sysdiag.cnrs.fr
Et Franck Molina, franck.molina@sysdiag.cnrs.fr
Tél. 04 67 16 66 39 ou 04 67 16 66 03