Je me permets de double poster pour vous signalez la réponse.
Le problème était que IE n'accepte pas les cookies d'un site contenu dans une frame du coup les sessions ne fonctionnent pas.
la solution est de rajouté
header('P3P: CP="CAO PSA OUR"');
en début de page.
Par contre je ne comprends pas ce code, si quelqu'un pouvait le commenter ce serait super sympa.
toutes les reponses ce trouvent à cette adresse : http://support.microsoft.com/kb/323752/fr où Microsoft explique lui même la cause, par contre le problème ne se cantonne pas à IE6 mais aussi 7 et 8.
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