Si tu ne stockes pas tes données dans une BD, tu les stockes très certaines dans un fichier. Fichier qui se trouve dans un répertoire. Fichier qui, par fainéantise, est accessible directement par une URL (mettons "http://monsitepassur.org/fichiers/carte_vital.pdf", en HTTP histoire d'enfoncer le clou

).
Quand tu es une quiche en configuration Apache (ou Nginx ou autres hein !), le dossier est "navigable" depuis n'importe quel navigateur. Et donc, en ayant l'URL d'un fichier, si on retire juste le fichier et que l'on saisie "http://monsitepassur.org/fichiers", tu vas avoir l'intégralité des fichiers présents dans le répertoire.
Quand tu stockes toutes tes données en BD (les fichiers y compris donc), cette situation n'est pas possible, sauf à le vouloir volontairement.
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